בית- צבי תוכנן ע"י האדריכל יעקב (קובה) פינקרפלד, והוקם בשנת 1952 לזכרו של צבי ורדי, חבר הקיבוץ, איש חינוך הגות ורוח, שנפטר משחפת בדמי- ימיו. הבניין שימש את ילדי המוסד החינוכי  (בי"ס תיכון). היו בו כיתות לימוד, מעבדה לפיזיקה, מעבדה לביולוגיה (שכללה תערוכת- פוחלצים, מאובנים ומינרלים) ספרייה ובה גלריה של ספריי לימוד ואולם גדול להתכנסות הנוער, שלימים הוסב לספרייה הגדולה של הקיבוץ (שפעלה במקום עד שנת 2014). 

על השלט של הבית נכתב: 'מכון אזורי לידיעת- המולדת'. במעבדת הטבע שבבניין היתה תלויה על הקיר תמונתו של צבי וכך נכתב על הקיר תחתיה: "לא זנים עדינים ומובחרים ויקרי מציאות אנו מגדלים, כי אם זיתים מסוקסים במקצת אבל רכי פארות ומושרשים בקרקע."

בשנת 2002 הסוכנות היהודית שיכנה בכתות המבנה מרכז קליטה לעולים מאתיופיה. משנת 2011 ועד היום הכיתה השמאלית בבניין משמשת את מרכז הקליטה ובית- ראשון במולדת לעולי חבר-העמים. משנת 2021 משמש החלל המרכזי של הבניין את  המכינה הקדם-צבאית לבנות במרחביה.